Um die Kaianlagen und diverse Steganlagen des Flensburger Hafens  zu unterhalten, unterhält die Hafen GmbH den Hafenbauhof. Um die  Kapazitäten des Hafenbauhofs optimal zu nutzen, werden Dienstleistungen  und Bauleistungen auch außerhalb des Flensburger Hafens angeboten.  Insbesondere im  Bereich der Hafenunterhaltung hat der Hafenbauhof bei  umliegenden Betreibern von Sportboothäfen einen guten Ruf.
Am Westufer südlich des Kraftwerkkais befindet sich die  Werkstatt und der Ausrüstungskai für die schwimmenden Gerätschaften des  Bauhofs. Als schwimmendes Gerät wird ein selbstfahrendes Arbeitsponton  inkl. Kran und Ramme vorgehalten. Mit diesem Arbeitsgerät werden ganze  Steganlagen errichtet bzw. im Hafen an den Kaianlagen sogenannte  Reibepfähle gesetzt. Hiermit können Pfähle aus Stahl und Holz bis zu  einer Gesamtlänge von 18 m verbaut werden.